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肿瘤基因组捕获测序

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肿瘤基因组捕获测序

产品简介:

        迈基诺肿瘤领域的服务内容主要分为遗传性肿瘤检测和常见肿瘤的治疗、预后、复发监测。其中,肿瘤驱动基因检测、循环肿瘤DNA(ctDNA)是迈基诺科研服务的重点内容。

1.驱动基因

        研究证明,人类癌症是由致癌基因和抑癌基因突变积累造成的。多数的基因突变都是没有功能或不是致病的突变;少部分基因突变具有致癌功能,是大部分肿瘤都共有的突变,叫做“Driver Mutation”。这一类型的突变是导致肿瘤发生的主要原因,突变所在的基因又称肿瘤驱动基因。肿瘤突变及其发病机制的研究应当首先集中在肿瘤驱动基因上。

        迈基诺公司自主研发的一系列“OncoCap”肿瘤驱动基因捕获试剂盒,包括高频肿瘤驱动基因,重要肿瘤信号通路相关基因(RTK-RAS-RAF,PI3K-AKT-mTOR,Cell Cycle,P53_DNA repair)和重要的由于扩增或缺失致癌的驱动基因等,同时,公司也提供个性化定制肿瘤驱动基因捕获试剂盒,广泛应用于肿瘤用药研究,预后及分子病理研究,为肿瘤科研和临床工作者全面系统的研究肿瘤的发生和演变机制提供了有效工具。迈基诺的驱动基因检测覆盖组织样本、血液样本,根据不同样本类型采取不同的测序策略。

 

  组织样本 血液样本
测序深度 500~1000X 50000~100000X
测序灵敏度 0.5% 0.05%

2.循环肿瘤DNA(ctDNA)

        ctDNA,即循环肿瘤DNA,指由肿瘤细胞释放到血液循环系统中的DNA。ctDNA具有含量少、片段小、半衰期短等特点。ctDNA的含量与肿瘤大小、分期等病理特征相关,并且携带着肿瘤细胞基因突变的序列信息。因此,对血浆、其他体液亦或某些分泌物中ctDNA进行检测已被越来越广泛地用于肿瘤筛查、病程监控、治疗效果评价等方面,其做为液体活检技术的代表被视为未来肿瘤检测的新趋势,具有安全、快捷、便利、灵敏度高等诸多优势,为肿瘤的病因、治疗、预后监测等提供了科学方法和高效工具。

产品列表

“OncoCap”系列肿瘤驱动基因捕获试剂盒:
OncoCap_48试剂盒
OncoCap_265试剂盒
OncoCap_30fuse试剂盒
OncoCap_725试剂盒
个性化订制肿瘤驱动基因捕获试剂盒;
肿瘤ctDNA解决方案


生物信息分析:

 
标准化分析 SNP/SNV;InDel;CNV/CNA; SV;Gene Mutation Frequency
个性化分析 Fusion Gene;Mutation Spectrum;Pathway Enrichment;
Chi-square Test;  Fisher’s Exact Test;Circos Map; 
Cancer Somatic Cell Mutation
 
测序策略:PE150

项目周期:30个工作日——捕获测序(自样本质控合格之日起,不包括数据分析),附加5~15个工作日进行数据分析。

 

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